精准医学生物信息实验室

Bioinformatics Laboratory for Precision Medicine

招聘

招聘岗位

  •  岗位:特聘副研究员(1-2名)、博士后
  •  方向:精准医学大数据、生物信息学、医学信息学等领域
  •  工作内容:参与国家精准医学重点专项研究、生物医学超算应用研究、中山医学院生物信息学研究,以及中山大学精准医学大数据中心建设。
  •  主要研究内容(可选择):
    1. 面向无参考基因组和无拼接组装基因组的组学序列数据的反向检索技术和图形基因组的研发和应用;
    2. 精准医学大数据的整合与注释的大型软件工作流的研究开发;
    3. 实现卷轴神经网路(CNN)和循环神经网络(RNN)等深度学习方法在组学数据研究中的应用。
  •  方法技术上涉及精准医学组学大数据采集,Hadoop / Spark平台上的分布式存储,图形基因组,大型数据索引与搜索、获取及其平台化等关键技术研究;应用上涉及基因型分析(如变异鉴别和功能分析)等。

应聘方式

  •  联系人:李伟忠 教授; 邮件: liweizhong@mail.sysu.edu.cn ; 有意应聘者请将(1)个人简历、(2)代表性业绩成果、(3)同行专家推荐信2份(可在面试前补上)等相关证明材料电子版发送至联系人。邮箱主题请注明:应聘【职位】- 【申请人姓名】。

副研究员

特聘副研究员(1-2人)

  •  岗位:特聘副研究员
  •  方向:组学大数据与生物信息学领域
  •  工作内容:参与国家精准医学重点专项研究、生物医学超算应用研究、中山医学院生物信息学研究,以及中山大学精准医学大数据中心建设。
  •  主要研究内容(可选择):
    1. 面向无参考基因组和无拼接组装基因组的组学序列数据的反向检索技术和图形基因组的研发和应用;
    2. 精准医学大数据的整合与注释的大型软件工作流的研究开发;
    3. 实现卷轴神经网路(CNN)和循环神经网络(RNN)等深度学习方法在组学数据研究中的应用。
  •  方法技术上涉及精准医学组学大数据采集,Hadoop / Spark平台上的分布式存储,图形基因组,大型数据索引与搜索、获取及其平台化等关键技术研究;应用上涉及基因型分析(如变异鉴别和功能分析)等。

招聘条件及福利待遇

  •  特聘副研究员:
    1. 工科、理科或医科博士毕业;
    2. 具有2项或以上代表性学术成果;
    3. 有跨计算机和生物/医学背景的优先考虑。
  •  福利待遇:
    1. 19-25万元 ,+ 绩效奖励0~10万, 业绩纳入年度奖励范畴;
    2. 按照中山大学专职科研人员和博士后管理规定执行,实行岗位绩效工资制,享有公费医疗、养老保险、住房公积金及租房补贴等福利待遇,协助解决子女入托、入学问题;
    3. 积极支持和鼓励获聘人员申请和主持各类科研项目;
    4. 获聘人员优秀者,聘期内或聘期结束时,可直接应聘学校副教授以上职位。

应聘方式

  •  联系人:李伟忠 教授; 邮件: liweizhong@mail.sysu.edu.cn ; 有意应聘者请将(1)个人简历、(2)代表性业绩成果、(3)同行专家推荐信2份(可在面试前补上)等相关证明材料电子版发送至联系人。邮箱主题请注明:应聘【职位】- 【申请人姓名】。

博士后

招聘博士后

  •  岗位:博士后(1-2名)
  •  方向:精准医学大数据、生物信息学、医学信息学等领域
  •  工作内容:参与国家重点研发计划-精准医学大数据的整合与注释;生物医学超算平台应用研究。
  •  主要研究内容(二选一):
    1. 精准医学大数据的整合与注释的大型软件工作流与应用大平台的研发;
    2. 面向无参考基因组和无拼接组装基因组的组学数据的图形基因组的方法学研究。
  •  方法技术上涉及精准医学组学大数据采集,Hadoop / Spark平台上的分布式存储,图形基因组,大型数据索引与搜索、获取及其平台化等关键技术研究;应用上涉及基因型分析(如变异鉴别和功能分析)等。

招聘条件及福利待遇

  •  博士后:
    • 年龄在35周岁以下;
    • 为海内外知名高校、研究机构的应届或往届博士毕业生;
    • 有跨计算机和生物/医学背景的优先考虑。
  •  福利待遇:
    1. 14-16万元    + 绩效奖励 0~6万, 业绩纳入年度奖励范畴;
    2. 按照中山大学专职科研人员和博士后管理规定执行,实行岗位绩效工资制,享有公费医疗、养老保险、住房公积金及租房补贴等福利待遇,协助解决子女入托、入学问题;
    3. 国外获得博士学位的特别优秀的博士,可申请“博士后国际交流计划”引进项目,每年资助约30万元人民币;
    4. 积极支持和鼓励获聘人员申请和主持各类科研项目;
    5. 获聘人员优秀者,聘期内或聘期结束时,可直接应聘学校副教授以上职位。

应聘方式

  •  联系人:李伟忠 教授; 邮件: liweizhong@mail.sysu.edu.cn ; 有意应聘者请将(1)个人简历、(2)代表性业绩成果、(3)同行专家推荐信2份(可在面试前补上)等相关证明材料电子版发送至联系人。邮箱主题请注明:应聘【职位】- 【申请人姓名】。

实验室新闻

课题组参加第11届国际生物审编大会并做报告(Biocuration 2018)

    2018年4月8日至11日,第11届国际生物审编大会(11th International Biocuration Conference)在上海复旦大学举行,Biocuration2018是全球生物信息领域重要学术会议,国际著名生物信息中心以及国内生物信息领域的数据库专家参会。实验室李伟忠教授受邀参会,并在大会作了题为“Domain annotation and combined alignment visualization enchance remotely related protein search with PSISearch2D”的学术报告,介绍了PSISearch2D在蛋白质序列比对和结构域可视化的应用,具有更高检索敏感性和更快的比对速度。(详见网站介绍:http://lilab2.sysu.edu.cn/psisearch2d/)

    李课题组博士研究生张文亮在大会做了关于“ncRPheDB:identify and prioritize associations between noncoding RNAs and disease phenotyes based on novel evidential metrics” 的poster展示。针对非编码RNA异常调节和疾病表型的相关性提供ncRPheDB的数据整合和可视化平台,用于预测疾病表型相关的参与调控非编码RNA,辅助治疗疾病。


第11届国际生物审编大会并(Biocuration2018)

课题组参加第二届中国计算机学会生物信息学会议(CBC2017)

    2017年10月13日,中山大学精准医学生物信息实验室李伟忠教授受邀参加第二届中国计算机学会生物信息学会议,并在大会作了题为“A bioinformatics platform system for omics data analysis”的学术报告,详细介绍了针对omics数据进行生物信息学分析的平台系统(http://lilab.sysu.edu.cn/Tools/),该平台可以提供包括序列相似性搜索(SSS),基因组数据workflow(GDW),深度学习分析(DLA),多序列比对(MSA)和蛋白质功能分析(PFA)等在内的多种应用性服务。

    精准医学生物信息实验室科研助理杨明磊在大会作了题为“基于Docker技术架构高移植性生物信息数据软件流虚拟web平台“的学术报告,介绍了Docker技术结合make搭建面向组学数据等生物信息分析软件工作流程的Docker容器。

    李伟忠教授博士研究生张文亮在大会做了关于”GDPTrDB: GDPTrDB: connecting Genotype, Disease, Phenotype Treatment” 的poster展示。GDPTrDB数据库整合了各种来源的突变相关的基因组数据,为研究人员提供人类疾病相关基因的突变信息、治疗方案、不良反应以及表型基因型的预测、文本挖掘评价等信息。

    由中国计算机学会主办的第二届中国计算机学会生物信息学会议(The Second CCF Bioinformatics Conference,简称CBC2017)旨在为从事生物信息学研究的专家、学者提供一个学术交流平台,促进我国生物信息学领域的学术交流与研究合作。会议邀请国内外生物信息学领域的著名专家、学者作大会报告,并就生物信息学领域的最新研究进展和动向开展讨论。


第二届中国计算机学会生物信息学会议